時間:2024年08月21日 分類:新聞中心 次數:
2024年8月18日,哈爾濱工業大學蔣慶華,哈爾濱醫科大學季勇、許召春共同通訊在Nature Communications 在線發表題為“Deciphering cell–cell communication at single-cell resolution for spatial transcriptomics with subgraph-based graph attention network”的研究論文,該研究提出了一種名為DeepTalk的通用方法,通過整合單細胞RNA測序(scRNA-seq)數據和空間轉錄組學(ST)數據,以單細胞分辨率推斷空間CCC。
細胞間通訊(CCC)的推斷對于更好地理解生物系統中復雜的細胞動力學和調節機制至關重要。然而,在單細胞分辨率下準確推斷空間CCCs仍然是一個重大挑戰。DeepTalk利用圖關注網絡(GAT)集成scRNA-seq和ST數據,從而能夠對單細胞ST數據進行準確的細胞類型識別,并對基于點的ST數據進行反卷積。然后,DeepTalk可以利用基于子圖的GAT捕獲多層次細胞之間的連接,進一步實現單細胞分辨率的空間分辨CCC推理。DeepTalk在多個跨平臺數據集上發現有意義的空間CCCs方面取得了優異的成績,這證明了其在復雜生物過程中剖析細胞行為的卓越能力。
Nature子刊陣容壯大,而在璀璨的星空中,Nature Communications(NC)以其獨特的身份脫穎而出。作為Nature打頭的綜合性期刊,NC雖同屬子刊序列,卻展現出別樣的風采。以其廣泛的接受領域、龐大的發文量,以及對高質量研究的開放態度,成為了眾多科研工作者展示成果的重要平臺。
Nature子刊,即Nature Research Journals,是科研細分領域的璀璨星辰,每一本都專注于某一特定研究方向,以深度與廣度并重的內容,成為各自領域內不可或缺的權威之聲。這些子刊不僅數量眾多,且質量上乘,多數擁有較高的影響因子,代表著所在領域的科研前沿與頂尖水平。
Nature旗下期刊(共200種),根據學術界的認可度與影響力,可大致劃分為5大類別:
01正刊:作為Nature系列期刊的領頭羊,《Nature》正刊以其無與倫比的權威性和影響力,穩居科研殿堂的頂端。
02Nature打頭的研究系列子刊與Review系列子刊:這兩大系列共計69本子刊,覆蓋了生命科學、物理科學、臨床醫學和社會科學等多個領域,以深度分析和前沿研究著稱,是各自領域的權威期刊。
03Nature Communications(NC):作為Nature打頭的特殊子刊,NC以其綜合性、開放性和龐大的發文量,成為連接科研人員與科研成果的重要橋梁。
04Nature 合作創辦的刊物:Nature出版集團與其他單位攜手合作,推出了128種高質量期刊,這些刊物在學術水平上不亞于子刊,為科研人員提供了更多元化的發表選擇。
05Scientific Reports:作為Nature Portfolio旗下的一本多學科開放獲取期刊,Scientific Reports以其廣泛的接受領域和快速的同行評審流程,為科研人員提供了一個展示初步研究成果的優質平臺。盡管有時被部分學者視為“水刊”,但其開放性和高效性無疑為科研界帶來了更多的活力和多樣性。
無論是以第一作者,通訊作者,還是第一單位在nature期刊發表論文,都可以帶來極大的榮譽,而且Nature始終以其卓越的品質和廣泛的影響力,引領著全球科研的潮流與方向。
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